Яна Клочкова родилась в Симферополе, а в 1997 году переехала в Харьков.

В 2001-м окончила Харьковское училище физической культуры и спорта. В 2004-м - Киевский национальный университет физвоспитания и спорта.

Клочкова установила 50 рекордов Украины. На Олимпийских играх в Сиднее установила мировой рекорд на дистанции 400 метров комплексным плаванием и рекорд Европы на дистанции 200 метров комплексным плаванием.

Спортсменка выиграла пять олимпийских медалей, в том числе четыре раза золото. Принимала участие в трех летних Олимпиадах - 2000, 2004 и 2008 годов.

В октябре 2008 года в СМИ появились сообщения со ссылкой на вице-президента Федерации плавания Украины Андрея Власкова о том, что Яна Клочкова решила завершить спортивную карьеру. Спустя несколько дней четырехкратная Олимпийская чемпионка заявила, что уйдет из спорта «тогда, когда посчитает нужным» и в этом случае выступит с соответствующим официальным заявлением.

В январе 2008 года Клочкова заявила об уходе из большого спорта.

24 марта 2009 года в олимпийском бассейне «Акварена» в Харькове во время первого этапа Кубка Украины по плаванию состоялось официальное «расставание с водой» Яны Клочковой и Дениса Силантьева. Сначала на экране демонстрировали кадры карьеры, заплывов, вручений наград и моменты из жизни чемпионов. Клочковой преподнесли в подарок живую золотую рыбку. Клочкова совместно с вице-чемпионом Олимпийских игр Денисом Силантьевым создала благотворительный фонд «Украина спортивная».

Яна Клочкова - Герой Украины, Заслуженный мастер спорта Украины, кавалер орденов Княгини Ольги І и ІІІ степени. Обладательница Креста Славы МВД «За международное сотрудничество в правоохранительной деятельности». Почетный гражданин Киева и Харькова.

С 2006 года - депутат Харьковского горсовета.